使用显微镜的一般步骤：
第一，取镜。
1.右手握住镜臂，左手握住镜底(如果用户是左撇子，则相反。下同)
2.将显微镜放在试验台上，稍微向左(显微镜放在距试验台边缘约7厘米的地方)。安装目镜和物镜。
第二，对光。
3.旋转转换器，使低倍物镜对准通光孔(物镜前部与载物台保持2厘米的距离)。
4.将较大的光圈对准通光孔。左眼注视眼镜(右眼睁开，同时绘制)。旋转反射镜，使光线通过通光孔反射到镜筒中。透过目镜，可以看到明亮的视野。
第三，观察。
5.观察。在载物台上放置切片或装片，标本面向通光孔中心。旋转粗准焦螺旋(顺时针)，俯首侧视镜筒缓慢下降，其二至物镜接近切片(约0.5cm)，左眼观察目镜，(反时针)旋转粗准焦螺旋，使物镜筒缓慢上升，看到物镜时轻微来回旋转细准焦，直至物像清晰。观察时要睁开眼睛，方便左眼观察，右眼看画面。侧边观察降镜筒→左眼观察找物像→准焦螺旋调清。
6.装片制作与移动：制作：滴水→放料→盖片。移动:如果物体偏向哪里，载玻片会向哪里移动。
7.高倍镜的转换，找到物像后，将要观察的物像移动到视野中央，将低倍镜移动，更换为高倍镜，只能用细准焦螺旋和反光镜清晰地调节视野，直到物像清晰为止。顺序:移动装置→转动镜头转换器→调整反射镜和光圈→调整准焦螺旋。
8.完成工作。用完后，取下装片，转动镜头转换器，逆时针旋出物镜。旋转到镜头盒;取出目镜，插入镜头盒，盖上。放置显微镜。注意：更换高倍物镜时，只能移动转换器，更换后，只能调整细准焦和反射镜(或光圈)。
注：试验结束后，将显微镜表面擦干净。旋转转换器，将两个物镜偏向两侧，并将镜筒慢慢降至最低。最好的办法就是将显微镜放物箱，放回原处。
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